Родился 20 мая 1923 года на хуторе Ковыловка Спасской волости Оренбургского уезда (ныне село относится к Саракташскому району Оренбургской области) в многодетной семье. В июле 1941 года был призван в Красную Армию. Воевал на Юго-Западном, Северо-Кавказском фронтах, участвовал в оборонительных боях 1941-1942 годов под Киевом, Харьковом, в обороне и освобождении Кубани, особо отличился в боях на Таманском полуострове.
В 1942 году окончил Воздушно-десантное училище РККА в городе Куйбышев (ныне Самара).
С 26 по 30 мая 1943 года в районе высоты 121,4 (ныне «Сопка Героев») гвардии старший лейтенант Иван Юркин лично уничтожил 175 солдат и офицеров. А его подразделение за эти дни уничтожило свыше 370 гитлеровцев, захватило три ручных и один станковый пулемёт, 5 автоматов, одну трофейную радиостанцию, около трёх тысяч патронов, подбило один танк, взяло в плен 10 человек.
30 мая 1943 года в боях за высоту 121,4 (ныне «Сопка Героев») Крымского района Краснодарского края Иван Юркин был тяжело ранен пулей в голову и эвакуирован в хирургический полевой походной госпиталь № 5, где умер от ран 2 июня 1943 года. Похоронен в братской могиле на площади в станице Холмской Абинского района Краснодарского края.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 25 октября 1943 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецкими захватчиками и проявленное при этом отвагу и героизм гвардии старшему лейтенанту Юркину Ивану Трофимовичу посмертно присвоено звание Герой Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».